西南大學植物保護學院，其前身是西南農學院植物保護系，始建于1952年， 2002年成為西南農業大學植物保護學院，2005年西南師范大學和西南農業大學合并后組建了西南大學植物保護學院。

學院現有教職工55名，客座教授12名。其中部級有突出貢獻專家1名，享受政府特殊津貼者4名，教育部新世紀優秀人才支持計劃入選者1名，中國農業科學院二級崗位杰出人才1名，重慶市學術與技術帶頭人及后備人選4名，巴渝學者特聘教授1名,重慶市名師1名；博士生導師7名，教授、研究員13名，副教授、副研究員17名，高級實驗師1名。

學院現有植物保護一級學科博士點1個，下設植物保護學博士后流動站1個，涵蓋植物病理專業、農業昆蟲與害蟲防治專業、農藥學專業、生物安全專業4個博士、碩士學位授權。學院設有植物保護、生物安全和制藥工程（農藥方向）3個本科專業，4個教學實驗室和6個教學實踐基地，實驗辦公面積達6000平方米。目前，有重慶市精品課程3門，1個重慶市重點實驗室，2個重慶市高校級重點實驗室。已經培養本科生3600余名、碩士研究生270余名、博士研究生60名、博士后10名；同時為國內外培養應用技術人員1000余人次 。

“十一五”期間，學院獲得各類科研項目100余項，經費2000余萬元。其中，“973”前期研究項目1項，國家級項目20余項，省部級項目50余項。獲得教育部長江學者及創新團隊1個，獲得省部級科技獎勵5項，發表學術論文237篇。分別有2篇博士和3篇碩士學位論文獲重慶市優秀學位論文，其中2篇博士學位論文分別獲全國百篇優秀博士學位論文及提名獎。

建院以來，植物保護學院全體教職員工秉承“崇德尚學、務本致遠”的院訓，始終奉行“勤懇求實、無私奉獻、以人為本、學術立院”的辦學理念；以學科建設為龍頭，教學、科研為中心，促進產學研緊密結合；為把植物保護學院建成國內有影響力的高水平研究型學院而努力奮斗。