首先，二者培養的目標不同，學術型碩士是為了培養學術研究人才，專業學位碩士是為了培養國家經濟社會發展急需的高層次應用型職業化人才。所以，專業碩士更側重于實踐、應用和技能，適用于找工作;而學術碩士則被稱為“傳統的研究生”，側重于理論研究、學術進修。而學術碩士畢業后主要是去研究所搞研發工作，而專業碩士主要是進入企業發展，就業更靈活，發展空間更大。
當然 ，很多學校二者培養方式基本一樣。

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