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動物遺傳育種與繁殖專業是在充分了解畜禽遺傳背景的基礎上，利用傳統和現代生物技術的方法培育出生產性能優良的畜禽品種。通過三年的課程學習和科研實踐，本專業培養的人才應具有遺傳育種與繁殖科學的堅實基礎理論和系統的專門知識，掌握基本的實驗操作技能和觀測數據處理分析方法，了解所研究課題方向的國內外發展動態；能用一門外語熟練地閱讀專業書刊文獻，具有初步的讀、寫、聽、說能力；能將計算機與本專業緊密地結合，解決一些生產實踐中存在的問題；具備從事動物遺傳育種與繁殖科學研究、教學、管理和技術推廣工作的能力。根據國內外的發展現狀，結合我校的實際情況，本專業主要設立以下四個方向：

（1）家畜繁殖

本方向主要從生殖生理、生殖生物技術等方面入手，尋求調節家畜繁殖能力的新方法和手段。在公畜生殖方面，圍繞精子發生調節機制這一科學問題，分別從類固醇激素合成調控機制，支持細胞發育和功能以及精子體外發生等方面進行系統而深入的研究；在母畜生殖方面，結合胚胎工程，開展胚胎早期發育、核質互作的研究工作，旨在充分發揮母畜的生殖潛力。

（2）分子遺傳學

為了充分利用家畜的遺傳優勢，必須對家畜有關性狀的遺傳機制進行系統的研究。本研究方向是在充分掌握和擁有家畜的生產性能資料的基礎上，利用分子生物學的技術和手段，找到與生產性狀想關的基因，并分析其遺傳機制，為家畜的育種提供直接的遺傳學上的資料。

（3）動物遺傳資源保護與利用

我國擁有豐富的畜禽資源，但是在盲目引進外來品種的同時，許多地方品種面臨滅絕的危險。本研究的目的就是在發現我國、特別是西南和重慶家畜遺傳資源的基礎上，研究動物遺傳資源評價、保護與開發利用的原理、方法和技術，保護我國特有的畜禽種質資源。

（4）家畜育種

在充分掌握特有家畜遺傳背景、生產性能的基礎之上，利用現代生物技術與傳統育種手段相結合的方法培育生產性能良好、抗病力強、繁殖力高的優良家畜品種。