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四川農業大學獸醫學科辦學歷史悠久，創辦于1912年的畜牧獸醫組，歷經獸醫系、畜牧獸醫系等不同發展階段，1994年納入動物科技學院，2007年納入獨立組建成立的動物醫學院。獸醫學學科1981年成為碩士學位授權學科；預防獸醫學學科于2000年成為博士學位授權學科；2005年獲獸醫學一級學科博士學位授權，2007年成為博士后科研流動站，2007年批準為重點（培育）學科；自“九五”起一直是國家“211工程”重點建設學科。

獸醫學科現有教師和教學輔助人員 74人，其中，教授21人，副教授 20人；有新世紀國家“百千萬人才工程”國家級人選1人、教育部新世紀優秀人才支持計劃2人、四川省學術和技術帶頭人6人、四川省學術和技術帶頭人后備人選16人、四川省有突出貢獻的優秀專家5人、享受國務院政府特殊津貼專家5人；有博士生導師14人、碩士生導師38人；有國家級教學團隊-動物預防醫學教學團隊（2008）1個、國家級科研創新團隊-教育部長江學者和創新團隊（2009）1個；有一級學科博士點 1 個、二級學科博士點 3 個、博士后流動站 1 個、二級學科碩士點 7 個。

學科以四川省重點學科（1996）、四川省“重中之重”學科（2004）、國家重點培育學科（2007），有動物醫學生物技術中心重點實驗室（1995）動物疫病與人類健康四川省重點實驗室（2004）、國家林業局國家級陸生野生動物疫源疫病監測（2005）、農業部水產用獸藥臨床藥效及殘留試驗單位（ 2007）、動物疾病與環境公害四川省重點實驗室（2008）、農業部“獸用藥物與獸醫生物技術”四川科學實驗觀測站（2011）等科技平臺為支撐，在動物重大疫病病原功能基因的發掘、改造與利用，禽類重要疾病的發病機理及防控，西南珍稀動物疾病監控與保護，危害淡水養魚重大疫病病原學及其致病機制等研究方向具有優勢。經過長期的積累和發展，學科整體實力明顯提高，已經逐步形成為特色鮮明、區域優勢明顯、整體實力位居國內同類學科的先進行列、西南地區相同學科中最強的學科。

近年來，學科承擔國家和省部級重大研究課題100余項，發表SCI/EI論文100余篇，出版專著20余部，“禽傳染性支氣管炎（新變型）綜合防治”獲四川省科技進步一等獎（2000）、“偽狂犬病病毒分子生物學及基因缺失疫苗株的研究”獲四川省科技進步二等獎（2001）、豬偽狂犬病活疫苗獲得國家新獸藥證書（2003）、“豬雞耐藥譜調查及針對性新藥研究”獲四川省科技進步一等獎（2004）、豬偽狂犬病基因缺失疫苗株（SA215）的研究和應用”獲國家科技進步二等獎（2005）、規模化養鴨主要傳染病防治關鍵技術的研究和應用獲四川省科技進步二等獎（2005）、滎經長毛兔選育及配套技術研究獲四川省科技進步一等獎（2006）、畜禽疫病防控體系無公害系列藥品開發及產業化示范獲四川省科技進步一等獎（2007）、植物源印楝油避孕制劑獲得國家專利（2007）、鴨傳染性漿膜炎滅活疫苗獲得國家新獸藥注冊證書（2009），一種檢測犬惡絲蟲的斑點酶聯免疫試劑盒獲得國家新型實用專利（2009）。

學科擁有實驗儀器750余件，萬元以上300件，總值3000余萬元。目前，獸醫學科正在建設生物安全二級實驗室（P2+）、SPF實驗動物屏障系統和潔凈細胞培養室，該工程的完成將推動我校獸醫學科上新臺階。