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基礎醫學學科包括了人體解剖與組織胚胎學、免疫學、病原生物學、病理學與病理生理學等4個二級學科26個研究方向，其中病原生物學和人體解剖與組織胚胎學是廣西重點學科。本學科利用地域資源優勢，針對桂西地區少數民族人群，開展廣西世居少數民族人類學、右江流域壯瑤醫藥基礎與應用、腫瘤分子病理學、桂西高發病免疫機制和環境因素對人體機能影響的病理生理學等研究，形成了富有特色的研究方向。

本學科現有教授20人、副教授39人，博士15人，全國優秀教師2人、八桂名師1人、自治區優秀教師4人。有碩士研究生導師26人，有國家中醫藥管理局三級實驗室1個、廣西高校重點實驗室2個、桂西少數民族人類學研究實驗中心和民族醫藥與分子生物學教學科研實驗中心各1個、廣西高校實驗教學示范中心3個及多個科研實驗室。

本學科近5年承擔研究課題211項，其中國家自然科學基金19項、省部級課題70項；發表論文539篇，其中SCI收錄15篇，EI收錄1篇；出版專著13部、教材18部；獲國家發明專利2項；獲科技及教學成果獎32項，其中包括廣西自然科學獎二等獎在內的省部級成果獎8項。