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微生物與生化藥學研究方向， 是以現代生命科學為基礎的新興學科，生物制藥已成為許多制藥企業研發的戰略重點，許多國家都把生物制藥作為優先發展的戰略性產業。本研究方向以基因工程、細胞工程、發酵工業、酶工程、蛋白質工程等高新技術為主體，在藥物基因組學與基因藥物及藥物蛋白質組學與蛋白質藥物，抗體藥物與疫苗藥物，微生物發酵工程與動物細胞工程三個方面開展深入研究。

本學科圍繞腫瘤、心腦血管疾病、自身免疫類疾病和重大傳染性疾病，建立并確認相關的靶點蛋白。在此基礎上建立一個包含傳統化合物、中藥等天然產物、蛋白質和短肽類的藥物篩選備選庫，按照從蛋白水平到細胞水平，再到模型動物水平，分別建立適應于不同藥物篩選靶點的高通量、自動化、大規模藥物篩選技術平臺，進行藥物篩選與驗證工作，從而加速藥物的發現和開發，獲得一批具有自主知識產權的核心技術產品。第一階段的工作重點主要針對SARS冠狀病毒、HIV、禽流感的藥物篩選。

在此學科方向上已經凝聚了一支高水平的人才隊伍，具有教師10人，其中教授7名，包括饒子和（中國科學院院士、第三世界科學院院士）、張耀洲、沈秉謙、朱濤、周澤奇（京津冀生物醫藥領軍人才）、劉勇、杜勇，承擔了多項國家級和省部級課題，包括國家863重大項目，國家科技支撐計劃項目、科技部973項目，國家自然基金項目以及天津市重點項目等。