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包括教育部／衛生部重點實驗室分子病毒實驗室、微生物和寄生蟲教研室以及P3實驗室

分子病毒實驗室病原生物學國家重點學科的主體之一，固定研究人員: 1８人，其中院士1人、教授3人、副教授級２人、中級6人、初級６人、在讀研究生４６人: 博士生２５人，碩士生２１人

研究重點：

病毒及細菌等病原微生物基因、致病性和機體防御機理的基礎和應用基礎研究
　
目標：

探索終止感染的途徑，為有效地預防和治療病毒和細菌性感染提出新思路和新方法。

在研課題：

973項目 3項、863項目5項、國家自然科學基金14項、教育部與上海市15項、國際合作項目５項，經費共約2000萬元

代表性成果：

乙肝治療性疫苗的研究（乙肝治療性疫苗目前正在進行臨床ＩＩb期試驗，初步臨床試驗結果顯示對乙肝患者有較好的治療作用 ）、乙型 肝炎病毒基因的變異及其生物學意義、炎病毒與宿主細胞的相互作用、重要病原菌的基因及功能基因組學研究、ＳＡＲＳ的診斷和疫苗研究

近年獲獎科研成果：

乙肝病毒抗原－抗體－重組質粒DNA復合物的組建及在治療乙肝中的應用獲教育部中國高校技術發明一等獎，現代醫學微生物學獲 全國優秀科技圖書一等獎，乙型肝炎病毒致病相關基因的研究獲上海市科技進步二等獎，乙型肝炎病毒復制性增強的機理研究獲全國優秀博士學位論文，表皮葡萄球菌生物膜形成分子機制獲教育部自然科學一等獎。

申報及授權專利(選登)：

1．抗原－抗體－重組DNA復合型疫苗。（美國發明專利：US 6,221,644 B1 國家發明專利號ZL971062919 )
2． 一種新型DNA疫苗載體（01105250．3）
3． 乙肝病毒多態性檢測芯片的制作方法及其應用（00116875．4）
4． 乙肝病毒全基因組多聚酶嵌合體及其組建方法和應用（01105685．1)

本重點實驗室開設的理論與實驗課程：

醫學分子病毒學、醫學分子病毒學實驗、現代醫學微生物學、 醫學微生物學前沿、 細胞微生物學，在已經獲得學位的研究生中，1人獲全國優秀博士學位論文，2人獲上海市優秀博士學位論文
本實驗室十分注重與國際之間廣泛的合作和交流。

P3實驗室概況

上海復旦大學三級生物安全防護實驗室由復旦大學和上海市科委共同出資1000多萬人民幣興建，位于復旦大學上海醫學院西園8號樓的西側一樓。建筑總面積～500 M2 ，其中BSL-3核心區～150 M2由三個功能區域組成： 2個普通BSL3實驗間，1個動物BSL3實驗間和1個BSL2準備間。非核心區包括機房及控制室，清潔洗滌及通道和常規實驗室等輔助設施，以及辦公和教學設施。

目前本實驗室共有工作人員10名，其中在編人員5名，兼職人員5名。所有工作人員均有明確的分工和職責，共同完成實驗室的各項管理、實驗操作及設施設備的維護維修工作。實驗室擁有多套保障生物安全，菌毒種保藏，細胞培養，動物實驗和分子生物學實驗的儀器設備，可開展多個與致病性微生物相關課題的研究。

承擔生物安全相關的教學與培訓是本實驗室的工作內容之一。實驗室具備良好的教學設備和空間進行講解、觀摩和操作演示。可為生物安全基礎知識普及，生物實驗室上崗前培訓，高等級生物安全實驗操作等不同層次人員提供教學服務。另外，新近開通的由衛生部和中科院研究生院完成的重點實驗室網絡協作平臺為異地教學，實時監控提供了先進的教學手段。