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公共管理系是經濟與管理學院最年輕的系，其前身是公共管理與公共政策研究所，2003年10月經學校批準，建立公共管理系。目前，公共管理系共有教師23人，其中教授7人，副教授8人，講師8人，具有博士學位教師18人，多位教師具有海外留學或訪問研究背景。

公共管理系培養公共政策與公共管理方面的高級人才，具有公共管理一級學科下行政管理、土地資源管理、社會保障、教育經濟與管理四個二級學科的碩士授予權。目前主要培養本專業本科生、碩士研究生以及管理科學與工程學科點下的城市發展與管理方向博士研究生，同時承擔MPA碩士研究生的教學工作。

在科研方面，公共管理系下設公共政策分析、公共管理、公共經濟與社會保障等學科組和研究所。主要研究方向有公共政策與評估、公共經濟與社會保障、公共組織與人力資源、社區發展與管理、教育與衛生管理、城市發展與管理等。承擔有國家自然科學基金、國家社會科學基金、教育部哲學社會科學重大課題以及聯合國開發署、聯合國環境署、世界銀行等多項國際合作項目，獲得國家發改委、上海市哲學社會科學、上海市決策咨詢優秀成果等多項科研獎項。