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南京醫科大學病理學和病理生理學學科具有悠久的歷史，鮮明的特色，長期以來以心血管病研究和腫瘤診斷及其研究而見長，是1981年國內首批碩士學位授予點之一。早在1988年就成為江蘇省教委重點學科，1994年晉級為江蘇省省級重點學科，"十五"期間繼續被遴選為省級重點學科，2000年成為博士學位授權點，2002年獲準建立江蘇省人類功能基因組學重點實驗室，2007年被遴選為國家重點（培育）學科，2011年獲得批準成立江蘇省心血管病分子干預重點實驗室。

五年來，本學科實行"學科、隊伍、基地"三位一體的發展戰略，以高技術研究平臺為依托，通過積極引進和大力培養優秀人才，打造學科亮點，使學科發展呈現良好的發展勢頭。1．學科梯隊明顯改善：五年來先后引進6名中青年教師，其中從國外引進教授2人。同時積極培養現有的人員，先后送出5名中青年教師到國外攻讀博士學位或做博士后研究。教師中具有博士學位的比例達到41%，形成了結構基本合理、學歷層次較高、極富發展潛力的人才梯隊。現有"333"工程第二、三層次培養對象各1人，"青藍工程"跨世紀學術帶頭人培養人選1人，江蘇省有突出貢獻的中青年專家3人，享受國務院特殊津貼的專家1人。2．構建共用技術平臺，開展高水平科研工作：五年來，本學科利用江蘇省功能基因組重點實驗室這一高技術平臺有效地開展了動脈粥樣硬化和糖尿病、腫瘤分子病理學、血吸蟲病抗病疫苗等方面的研究，取得了重要進展。先后申請到國家"973"、"863"、國家自然科學基金等國家級科研項目18項，省級科研項目14項，科研經費達881萬元，高職人均每年科研經費52萬元。發表論文300余篇，其中高級職稱發表論文161篇，被三大檢索系統收錄論文43 篇，獲省部級以上獎勵6項。3．強化人才培養：五年來本學科共招收博士生35人，碩士生86人，授博士學位8人，碩士學位36人。研究生在學期間發表論文數51篇，其中在SCI收錄刊物上發表論文15篇，獲江蘇省優秀碩士學位論文1篇。獲得1項研究生創新工程課題資助。除了研究生培養外，本學科還增辦了臨床病理學和醫學司法鑒定兩個本科新專業。 4．積極開展學術交流：本學科與國內外多個實驗室開展協作交流，如英國London大學、劍橋大學，美國哈佛大學、德州大學、匹茲堡大學、東田納西州大學等。有7人次赴境外參加國際學術會議或短期訪問。主辦省內、國內重要學術會議3次，有4人在省級以上學術團體擔任重要職務。長期以來本學科點一直是中國病理生理學會動脈粥樣硬化專業委員會的掛靠單位，江蘇省病理生理學會的理事長單位，為相關研究領域的學術交流和發展做出了應有的貢獻。

現在編人數為26人，其中高級職稱9人（教授6人、副教授3人，其中博士生導師5人、碩士生導師2人），中級職稱10人（講師7人、實驗師3人），初級職稱7人（助教4人、助理實驗師3人）。