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天津大學、南開大學是天津市兩所歷史悠久的名校，10年來，僅一墻之隔的兩校遵循“理工結合、文理滲透、優勢互補”的原則，整合創新力量和資源，突破體制機制障礙，在人才培養、科技創新等方面開展合作，建立了協同創新的戰略聯盟。

2000年12月25日，教育部與天津市政府簽署重點共建南開大學、天津大學的協議。2001年，比鄰而居的兩校利用各自辦學優勢和教學資源配置互補的特點，通過互開素質教育課程、互開輔修專業、互修雙學位、互推免試研究生、互聘任課教師、開放實驗室等項目建設，在高素質拔尖創新人才培養方面展開深度合作。合作辦學以來，互開素質教育課程50多門，57000人次選課；互設輔修專業2個，2400名學生學習；260余名學生互修雙學位；400余名學生互推免試研究生；兩校名師如數學大師陳省身、加拿大皇家學院院士葉嘉瑩、中科院院士張春霆等都曾為對方學校學生授課；兩校還建設聯合實驗樓，供學生共同學習實驗。

兩校在本科生和研究生的聯合培養模式上進行了有益探索。在本科生培養方面，兩校2003年合辦“分子科學與工程”和“光電子技術科學”兩個新專業，聯合招生并進行輪換制培養，組建專業教學指導小組，聯合制定培養方案、聘任授課教師，迄今已有300余名學生畢業。合辦的新專業填補了我國高校的專業空白，培養了緊缺人才。在研究生培養方面，兩校開設互選課程、互聘教師，舉辦“南開大學-天津大學研究生聯合學術節”，形成包括院士論壇、院長論壇、人文沙龍等子欄目在內的大講堂和學術征文活動。在此基礎上，兩校正進一步籌劃推出碩博“雙學位”項目、“雙導師”制、研究生精品課程等。

如今，兩校圖書館實現館際互借、互閱，互為研究生及教師辦理對方借閱證，并共建劉徽應用數學研究中心、天津綠色化學化工國家實驗室、光電信息技術科學教育部重點實驗室。