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同濟大學一貫重視研究生教育，早在20世紀50年代初即在部分專業招收培養研究生。1978年學校恢復招收碩士研究生，1981年起招收博士研究生， 同年被國務院學位委員會批準為首批有權授予博士、碩士學位的單位。1986年經國務院批準試辦研究生院，1996年經評估正式成立研究生院，成為我國培養高層次專門人才的重要基地之一。
 
我校現擁有博士學位授權的一級學科點31個（含僅有二級學科博士學位授權的一級學科3個），有碩士學位授權的一級學科點55個（含僅有二級學科碩士學位授權的一級學科點6個）。博士碩士學位授權點學科覆蓋哲學、經濟學、法學、教育學、文學、理學、工學、醫學、管理學、藝術學等10大學科門類。其中土木工程、建筑學和交通運輸工程為一級學科國家重點學科；海洋地質、環境工程、工程力學、材料學、機械設計及理論、控制理論與控制工程、大地測量學與測量工程等7個學科為國家重點二級學科；基礎數學、凝聚態物理、車輛工程等3個學科為國家重點（培育）學科。上述學科在全國高校同類學科中處于優勢和領先地位；管理、理學、人文社科、醫學、藝術學等學科近年有了長足發展。我校還設有16個博士后科研流動站。按照教育部調整和完善我國學位與研究生教育模式的工作部署，我校于2009年又啟動了全日制專業學位教育項目，旨在優化研究生培養結構，建立以創新能力為核心的工程類人才培養模式，使之符合現代教育規律、滿足我國工程界對人才的需求。學校還十分注重培養不同類型的高層次專門人才。學校既設學術型學位，又設職業型學位（專業學位），15大類職業型學位為：金融碩士、應用統計碩士、法律碩士、翻譯碩士、建筑學碩士、工程博士碩士、城市規劃碩士、風景園林碩士、臨床醫學博士碩士、口腔醫學博士碩士、工商管理碩士（MBA、EMBA）、公共管理碩士、會計碩士、工程管理碩士、藝術碩士。既培養學術型、研究型研究生，又培養應用型、復合型專業學位研究生；既有在校全日制攻讀學位模式，又有在職人員攻讀專業學位或以同等學力申請博士、碩士學位等等。此外，還面向社會舉辦多種專業研究生課程進修班等，充分發揮我校學科優勢和特色，由此形成了多渠道、多規格、多層次的辦學模式，取得了良好的社會效益。

同濟大學研究生院是校長領導下具有相對獨立職能的研究生教學和行政管理機構，下設研究生院綜合處、研究生招生處、在職教育管理處、管理處、培養處、嘉定校區研究生工作辦公室等。同時，學校黨委還專門設立了研究生工作部。學校學位評定委員會日常管理機構學位辦公室設在研究生院。按學科大類、學科特色，校學位評定委員會分設17個學位評定分委員會，以一級學科為單位設有45個學科專業委員會，以專業學位類型設有10個專業學位教育指導委員會，以工程碩士領域設有18個工程碩士領域教育指導委員會。各研究生培養單位設有研究生管理部門，配有學位秘書、教務員、班主任、研究生教學秘書等行政管理人員。研究生院曾多次被評為全國和上海市學位與研究生教育管理工作先進集體。

研究生教育三十多年來，同濟大學始終把全面提高培養質量作為研究生教育改革的指導思想，在嚴格質量管理方面采取了一系列切實有效的措施，取得了較好效果。在連續幾年全國百篇優秀博士學位論文評選中，有8篇入選。同濟大學為國家培養了一大批高素質的高級專門人才，至今已授予博士學位5085人，碩士學位36241人，其中有相當一部分已成為我國社會主義現代化建設的重要骨干力量和杰出人才。同濟大學將繼續堅持以服務社會為使命和責任，為我國經濟建設和社會發展輸送高質量、高層次人才做出更大的貢獻。

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