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動物研究所歷史悠久，人才輩出，貢獻卓著。1962年由昆蟲研究所和動物研究所合并成為現在的動物研究所。動物研究所目前擁有三個國家重點實驗室，即計劃生育生殖生物學國家重點實驗室、農業蟲鼠害綜合治理研究國家重點實驗室、與清華大學和北京大學聯合的生物膜與膜生物工程國家重點實驗室；建立了動物生態與保護生物學院重點實驗室和動物進化與系統學所級重點實驗室；有樣本量達580萬余的動物標本館；還建立了國家動物博物館，以及眾多的野外觀察研究臺站和基地。研究所主要定位在圍繞農業、生態、環境和人類健康及其人與自然協調并存等方面的重大需求和科學問題，在珍稀瀕危動物保護、有害動物控制、資源動物可持續利用、動物疾病預警與防控、生殖與發育生物學、動物系統學和進化生物學等領域開展基礎性、前瞻性、戰略性研究。動物研究所在2003年全國一級學科生物學學科評估中整體水平排名第二，2009年全國一級學科生物學學科評估中整體水平排名第五，在2005年及2010年獲得全國優秀博士后流動站榮譽稱號。1981年，國務院學位委員會批準動物研究所為我國首批具有博士、碩士學位授予權單位；1987年獲準開展具有研究生畢業同等學力的在職人員理學碩士學位、博士學位資格授予工作；1988年經全國博士后管委會批準建立博士后科研流動站；1994年獲準為博士生導師自行評定單位；1997年、2000年先后兩次被評為中國科學院博士生重點培養基地；1998年被國務院學位委員會批準為一級學科（生物學）博士、碩士學位授予權單位；2008年，動物研究所“生態學”獲得北京市重點學科建設資助；2011年，生態學、動物學、發育生物學、細胞生物學四個學科被中科院評為重點學科。2010年，增設生物工程碩士培養點；2011年，又成功增列生物醫學工程、免疫學、病理學與病理生理學三個學術型碩士培養點。現有在學研究生600多人。

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